Category: News

On Wednesday 20 April 2011 Hoe?Zo! Radio interviewed Albert Heck, scientific director of the NPC, about proteomics research and the Netherlands Proteomics Centre.

To listen to the interview click here

Vidi grant for Shabaz Mohammed

Shabaz Mohammed has been awarded a Vidi grant for his proposal entitled: Decoding Cellular Communication by the Dutch Organisation for scientific Research (NWO).

Internal communication is key for cells to perform their function. Stem cells can become any cell type if the right signals are generated. This research aims to develop tools to decode internal communication of stem cells during such a transition.

 

The Vidi grant aims at the researcher who after having obtained his or her PhD already has conducted research for several years on a post-doc level and who has shown to be able to generate innovative ideas and independently and succesfully develops them. Researchers are given the opportunity to develop their own innovative research line and to appoint one or more researchers. The grant amounts to a maximum of 800,000 euros

Albert Heck co-director of INSTRUCT Associate Centre for Mass Spectrometry

Albert Heck (Biomolecular Mass Spectrometry and Proteomics Group, University Utrecht) and Carol Robinson (Physical and Theoretical Chemistry Laboratory, University of Oxford) will co-direct the INSTRUCT Associate Centre for Mass Spectrometry.

INSTRUCT is part of the European Strategy Forum on Research Infrastructures (ESFRI) and is funded by the European Union’s Seventh Framework Programme. It will link the information obtained by the major structural biology methods with state-of-the-art cell biology techniques to provide a dynamic picture of key cellular processes at all scales with a focus on a few key biomedical questions and environment problems.

Péter Horvatovitch  (University of Groningen, NBIC) and Bas van Breukelen (University of Utrecht, NBIC-NPC) won the “Enlighten your Research” -award for their proposal “High Speed light path network for the Netherlands Bioinformatics for Proteomics Platform”. The prize giving ceremony by Minister Plasterk was part of the launching event of GigaPort3 on February 18th 2010.

“Enlighten your research” is a competition on dynamics light paths, organised by SURFnet and NWO. The winners get free access to the light path network and 20.000 Euro to integrate light paths in their research. “With this price we can now create high speed computer networks to analyze large and complex mass spectrometry data.”, says Bas van Breukelen.

For more information about the competition and the proposals you can visit the SURFnet website.

Terugkeer van hoofd-halskanker bij patiënten te voorspellen

Aanwezigheid eiwit voorspelt risico op terugkeer tumor

 

Bij ongeveer 20% van de patiënten komt na een operatie aan een hoofd-hals tumor, de tumor weer terug. Tot voor kort was het onmogelijk om te voorspellen bij welke patiënten dit wel of juist niet zou gebeuren. Nu blijkt dat een lage concentratie van de eiwitten keratine 4 en cornuline in het slijmvlies goed voorspelt welke patiënten een groter risico lopen dat de tumor terug zal keren. Dit blijkt uit promotieonderzoek van onderzoekster Tieneke Schaaij-Visser van het Netherlands Proteomics Centre en de Universiteit Utrecht in samenwerking met het VU Medisch Centrum. Voor het ontdekken van het juiste eiwit vergeleek Schaaij honderden eiwitten uit weefsel van gezonde mensen met weefsel van (pre)kankerpatiënten.

 

Jaarlijks krijgen 2500 Nederlanders hoofd-halskanker oftewel kanker die ontstaat in het slijmvlies van de mond-keelholte en het strottehoofd. Hoofd-halskanker is hardnekkig. Zelfs na microscopisch onderzoek van de patholoog aan de randen van de uitgesneden tumorwaarbij in principe de conclusie is dat de tumor volledig is verwijderd, komt bij ongeveer 20% van de patiënten de tumor terug. In het onderzoek zijn honderden eiwitten van normale weefsels vergeleken met eiwitten van (pre)kanker weefsels van patiënten. Naar voren komt dat sommige eiwitten wel aanwezig zijn in gezond weefsel, maar nauwelijks in tumor weefsel, of omgekeerd. Bij verschillende patiëntengroepen is vervolgens getest of deze eiwitten voorspellen dat de tumor terug zal keren. De resultaten hebben aangetoond dat de lage concentratie van de eiwitten keratine 4 en cornuline verband houden met het terugkeren van de tumor bij patiënten die geopereerd zijn aan een tumor in het hoofd-hals gebied. Patiënten die een hoog risico lopen dat de tumor terug zal keren, komen in aanmerking voor extra controle in het ziekenhuis en eventueel preventieve behandeling. Aanvullend onderzoek is nodig om het in de toekomst te kunnen invoeren.

 

Tieneke Schaaij-Visser zal haar proefschrift ‘Biomarker discovery for head and neck cancer: a proteomics approach’ verdedigen op 20 januari 2010 in het Academiegebouw te Utrecht. Het promotieonderzoek is een gezamenlijk onderzoeksproject van het VU Medisch Centrum, KNO en Hoofd-Halschirurgie (Prof. R.H. Brakenhoff) en het Netherlands Proteomics Centre, de Universiteit Utrecht, Biomoleculaire Massaspectrometrie en Proteomics Groep (Dr. M. Slijper) en is gefinancierd door het Netherlands Proteomics Centre.

Technology Foundation STW has awarded NPC researchers Albert Heck and Esther van Duijn (UU) a STW Grant of 992k euro. In collaboration with MS Vision and Merus, Heck and van Duijn will use their grant to characterize antibodies for therapeutic applications.